Molekulová destilácia krátkej cesty ponúka mnoho presvedčivých výhod, ktoré ju robia lepšou voľbou na spracovanie citlivých materiálov. Najdôležitejšie je, že jej schopnosť pracovať pri extrémne nízkych tlakoch významne zníži varové body zlúčenín, čo umožňuje ich separáciu pri oveľa nižších teplotách ako pri bežných metódach destilácie. Táto vlastnosť je kľúčová na zachovanie integrity teplotne citlivých materiálov, prevencia termálneho rozkladu a udržanie kvality produktu. Krátky vzdialenosť medzi evaporátorom a kondenzátorom minimizuje čas, ktorý molekuly strávia vo fázii páru, čím sa zníži riziko rozkladu a zabezpečí vyššiu čistotu produktu. Ďalšou významnou výhodou je systému jeho vysoká účinnosť separácie, dosiahnutá vytvorením tenkého filmu na povrchu evaporátora, čo podporuje rýchlu a rovnomernú evaporáciu. Technológia tiež preukazuje vynikajúcu univerzálnosť pri spracovaní rôznych typov materiálov, od viackrátstych olejov po zlúčeniny s vysokou molekulovou hmotnosťou. Proces sa vykonáva spojito, čo umožňuje konzistentné výrobné tempo a spolehlivú kontrolu kvality. Okrem toho pomerné podmienky spracovania vedú ku minimálnemu stratám produktu a vyšším výnosom v porovnaní so tradičnými metódami separácie. Automatizovaná príroda moderných systémov molekulovej destilácie krátkej cesty zníži požiadavky na prácu, zatiaľ čo zabezpečí presnú kontrolu nad parametrami spracovania. Navyše schopnosť technológie fungovať bez chemických rozpútačov ju činí životním prostrediu príznivou a zníži požiadavky na ďalšie etapy spracovania. Tieto výhody kombinujú, aby z molekulovej destilácie krátkej cesty nevyhnutný nástroj pre priemysly, ktoré vyžadujú produkty s vysokou čistotou a pomerné podmienky spracovania.